Tata Nama Enzim

Prinsip Penamaan

Enzim dikelompokkan dan diberi nama berdasarkan reaksi yang dikatalisisnya. Hanya merujuk pada perubahan reaksi kimia yang disebabkan oleh enzim. Mekanisme reaksi tidak dimasukkan dan juga gugus prostetik atau kofaktor tidak masuk dalam nama.

Tata Nama

Menurut Enzyme Commission (1961), enzim dibagi atas enam kelas tergantung pada reaksi yang dikatalisis.

E.C.a.b.c.d

–     a. Kelas enzim

–     b. subkelas enzim

–     c. Sub-sub kelas enzim

–     d.Sub-sub-sub kelas enzim

Pengelompokan tidak berdasarkan urutan asam amino, struktur tiga dimensi dan juga tidak berdasarkan prosedur reaksi

Klasifikasi Enzim

1. Oksidoreduktase
2. Transferase
3. Hidrolase
4. Liase
5. Isomerase
6. Ligase

 1.      Oksidoreduktase

Mengkatalisis transfer atom H, O atau elektron dari satu substrat ke yang lain.

Digit kedua: Hidrogen atau donor elektron

ü  1. Alkohol

ü  2. Aldehid atau keton

ü  3. CH-CH

ü  4. Amin primer

ü  5. Amin sekunder

ü  6. NADH atau NADPH

Digit ketiga: Hidrogen atau penerima elektron

ü  1. NAD⁺ atau NADP⁺

ü  2. Fe ³⁺

ü  3. O₂

ü  99. Akseptor lain

Nama sistematik ditulis menurut: donor:akseptor oksidoreduktase

–        EC. 1.1.1.1

–        Nama Sistematik: Alkohol:NAD⁺ oksidoreduktase

–        Nama Trivial: Alkohol dehidrogenase

     (Nama trivial: Oksidase, transfer H ke O₂; dan dehidrogenase, untuk transfer H ke penerima selain O₂)

2.      Transferase

•         Katalisis transfer gugus fungsi khusus menyerupai metil, asil, amino, glikosil, atau fosfat dari satu senyawa ke senyawa lain.

            AX + B -------- BX + A

•          Nama berakhiran X-Transferase, X yakni gugus yang ditransfer.

•         Nama sistematik ditulis menurut: Donor:akseptor gugus transferase

•      Digit kedua merupakan gugus yang ditransfer

–     1. satu gugus karbon

–     2. Gugus Aldehid atau keton

–     3. Gugus Asil

–     4. Gugus glikosil

–     7. Gugus fosfat

•      Digit ketiga: menjelaskan lebih lanjut gugus yang ditransfer

–     E.C.2.1.1: metiltransferase

–     E.C.2.1.2: hidroksimetiltransferase

–     E.C.2.1.3: karboksil atau karbamoil transferase

3.      Hidrolase

•         E.C.2.7.1: fosfotransferase dengan gugus alkohol sebagai akseptor

•         E.C.2.7.2: Fosfotransferase dengan gugus karboksil sebagai akseptor

•         E.C.2.7.3: fosfotransferase dengan gugus nitrogen sebagai akseptor

•         Fosfotransferase memiliki nama trivial dengan akhiran kinase

•         Hidrolase

•      Mengkatalisis reaksi hidrolis

A-X  + H₂O  --------- X-OH  + HA

Digit kedua: Jenis ikatan yang dihidrolisis

•      1. ester

•      2. glikosidik

•      4. peptida

•      5. C-N selain peptida

Digit ketiga: menjelaskan lebih lanjut jenis ikatan yang dihidrolisis

•      Nama substrat diberi akhiran –ase. Nama sistematik selalu mengikuti hidrolase.

•         E.C.3.1.1. Ester karboksilat

•         E.C.3.1.2. Ester tiol

•         E.C.3.1.3 Monoester fosfat

•         E.C.3.1.4 Diester fosfat

4.      Liase

•      Mengkatalisis pemutusan ikatan C-C, C-O, C-N, C-S.

•      Nama sistematik ditulis berdasarkan substrat gugus liase.

•       Nama trivial, contohnya dekarboksilase, aldolase, dehidratase (eliminasi CO₂, aldehid, dan air).

•      Digit kedua: ikatan yang diputus

–     1. C-C

–     2. C-O

–     3. C-N

–     4. C-S

•      Digit ketiga: gugus yang dihilangkan. Untuk C-C liase

–     1. gugus karboksil

–     2. gugus aldehid

–     3. gugus asam keto

5.      Isomerase

•      Mengkatalisis penataan struktur atau geometri dalam molekul.

•      Enzim diklasifikasikan berdasarkan jenis reaksi yang terlibat.

•      Digit kedua: Jenis Reaksi

ü  1. Rasemisasi atau epimerisasi

ü  2. Isomerisasi cis-trans

ü  3. Oksidoreduktase intramolekul

ü  4. Reaksi transfer intramolekul

•      Digit Ketiga: jenis molekul yang mengalami isomerisasi

ü  1. asam amino

ü  2. asam hidroksi

ü  3. Karbohidrat

6.      Ligase

•         Mengkatalisis pembentukan ikatan baru, disertai dengan hidrolisis ATP atau nukleosida trifosfat lainnya.

      X    +    Y    +  ATP -------------  X-Y  + ADP  + Pi

•         Nama sistematik X:Y ligase

•         Digit kedua: jenis ikatan yang dibentuk

ü  1. C-O

ü  2. C-S

ü  3. C-N

ü  4. C-C

•         Digit ketiga: menjelaskan lebih lanjut ikatan yang dibentuk

•         E.C. 6.3.1 asam-amonia ligase (amida, sintase)

•         E.C. 6.3.2 asam-asam amino ligase (peptida, sintase)

•         Contoh

•      ATP + D-glukosa ------------------- ADP + D-glucose 6-phosphate

•      Nama Sistematis: ATP:glucose phosphotransferase

•      Nama yang Direkomendasi (trivial): Heksokinase

•      EC number: 2.7.1.1

ü  (2) transferase

ü  (7) phosphotransferase

ü  (1) gugus hidroksil sebagai akseptor

ü  (1) nomor seri yang diberikan secara acak 

Sumber http://wanenoor.blogspot.com/

Share this post

Berlangganan update artikel terbaru via email: